A Biblioteca Central de Estudos Africanos constitui um esforço conjunto de quatro centros de investigação na área dos estudos africanos: o Centro de Estudos Africanos do ISCTE-IUL, agora Centro de Estudos Internacionais (CEI-Iscte), o Centro de Estudos Africanos da Universidade do Porto , o Centro de Estudos sobre África e do Desenvolvimento do ISEG-UTL, e o Centro de Estudos Africanos da Faculdade de Letras da Universidade de Lisboa. A biblioteca está instalada numa ala da Biblioteca do Iscte, e reúne cerca de 15 mil volumes. A fonte de financiamento para fundação da BCEA foi o Projeto de Reequipamento Científico (REEQ/26/SOA/2005), da FCT – Fundação para a Ciência e a Tecnologia, entidade gestora e financiadora do mesmo projeto.