O CEI-IUL está envolvido ativamente no ensino pós-graduado, em Portugal e internacionalmente.

No ISCTE-IUL, os investigadores integrados do CEI-IUL colaboram nos programas de Mestrado em:

e no programa de doutoramento em

Em paralelo, os membros do CEI-IUL cooperam no programa de Mestrado em História de África no Departamento de História da Universidade de Lisboa.

Ao nível internacional, os membros do CEI-IUL colaboram com outras universidades, designadamente Université de Paris 7-DiderotUniversité de Lille 1Universidade Eduardo MondlaneUniversidade Agostinho Neto e Indian Institute of Technology Gandhinagar.

O CEI-IUL promove a integração de estudantes pós-graduados e jovens doutorados no quadro dos seus projectos. Presentemente, 21 colaboradores em projectos estão a preparar teses de mestrado e doutoramento no CEI-IUL e participam nas atividades de investigação em desenvolvimento. Seis investigadores pós-doutorais trabalham correntemente no CEI-IUL.